Text

Kloning Kristal Protein Bacillus thuringiensis Aktif Melawan Nematoda Akar-Simpul

---

ABSTRACT
VERONICA HESTI CANDRANINGRUM. 24020115140106. Cloning of a
Bacillus thuringiensis Crystal Protein Active Against Root-Knot Nematode.
Supervised by Dr. rer. nat. Anto Budiharjo, M. Biotech. and Dr. Rejeki Siti
Ferniah, M.Si.
Plant-parasitic nematodes (PPNs) are the primary pathogens of crop plants
and may cause an annual economic loss of approximately $125 billion worldwide.
Meloidogyne, Heterodera, and Globodera play the main role of the crop plants
destruction. The application of chemical nematicides is currently one of the
primary means to control them but having no lethal activity and toxic to the nontargets. This work aimed to discover environmental friendly nematicidal proteins
of Bacillus thuringiensis (Bt) Thai strains to control PPNs. Forty-six Bt strains
were grown on growth agar media and streaked into sporulation agar media.
Spores were collected, purified, and boiled, used for SDS-PAGE samples. Four
potential Cry proteins are known for their high toxicity; Cry5 (140 kDa), Cry6 (54
kDa), Cry21 (130 kDa), and Cry55 (45 kDa). Through the screening process, a
~54 kDa protein band with its ~1.4 kb gene band was shown on both
electrophoresis gels and suspected to be cry6. The PCR products were ligated to a
blunt-end cloning vector, transformed into E. coli DH5α, and cultured on
antibiotic media. Plasmid from the positive colony was extracted and used for
sequencing analysis. BLAST alignment was conducted, but shows no similarities
to the known cry6.
Keyword: Bacillus thuringiensis, crystal protein, gene cloning, root-knot
nematode

ABSTRAK
VERONICA HESTI CANDRANINGRUM. 24020115140106. Kloning Kristal
Protein Bacillus thuringiensis Aktif Melawan Nematoda Akar-Simpul.
Dibimbing oleh Dr. rer. nat. Anto Budiharjo, M. Biotech. and Dr. Rejeki Siti
Ferniah, M.Si.
Nematoda parasit-tanaman (PPN) adalah patogen utama tanaman dan
dapat menyebabkan kerugian ekonomi tahunan sekitar $ 125 miliar di seluruh
dunia. Meloidogyne, Heterodera, dan Globodera memainkan peran utama dalam
kerusakan tanaman panen. Aplikasi nematisida kimia saat ini adalah salah satu
cara utama untuk mengendalikan PPN, tetapi tidak memiliki aktivitas yang
mematikan dan beracun bagi organisme non-target. Penelitian ini bertujuan untuk
menemukan nematisida ramah lingkungan dari galur Bacillus thuringiensis (Bt)
asli Thailand untuk mengendalikan PPN. Empat puluh enam strain Bt
ditumbuhkan pada media agar pertumbuhan dan dipindahkan ke media agar
sporulasi dengan metode streak. Spora dikumpulkan, dimurnikan, dan direbus,
digunakan untuk sampel SDS-PAGE. Empat protein Cry yang potensial dikenal
karena toksisitasnya yang tinggi; Cry5 (140 kDa), Cry6 (54 kDa), Cry21 (130
kDa), dan Cry55 (45 kDa). Melalui proses screening, pita protein berukuran ~54
kDa dengan gen berukuran ~1,4 kb yang muncul pada kedua gel elektroforesis.
Keduanya diduga kuat sebagai protein Cry6 yang disandikan oleh gen cry6.
Produk PCR diligasikan ke vektor kloning, ditransformasikan ke dalam E. coli
DH5α, dan dikultur pada media antibiotik. Plasmid dari koloni positif diekstrak
dan digunakan untuk analisis sekuensing. Berdasarkan hasil penjajaran BLAST
dengan sequence cry6 yang telah diketahui, tidak ditemukan kemiripan sequence
antara hasil cloning dengan sequence cry6 yang telah diketahui.
Kata kunci: Bacillus thuringiensis, kristal protein, kloning

---

Ketersediaan

1367BIV

1367 B 19iv

Perpustakaan FSM Undip (Referensi)

Tersedia

Informasi Detail

Judul Seri

BIOLOGI

No. Panggil

1367 B 19iv

Penerbit

: ., 2019

Deskripsi Fisik

-

Bahasa

Indonesia

ISBN/ISSN

-

Klasifikasi

532.37

Tipe Isi

-

Tipe Media

-

Tipe Pembawa

-

Edisi

-

Subjek

-

Info Detail Spesifik

-

Pernyataan Tanggungjawab

Veronica Hesti Candraningrum.

Versi lain/terkait

Lampiran Berkas

Komentar

---

Anda harus masuk sebelum memberikan komentar