Text

Interaksi Peptida Ac-CA-NH2 dan Ac-VC-NH2 Dengan Ion Logam K+ dan Na+: Studi Komputasi Ab-Initio

---

ABSTRAK

Interaksi antar molekul atau non-covalent interaction memainkan peran penting dalam proses kimia. Salah satu proses penting yang dapat dipelajari adalah interaksi antara peptida dengan ion logam yang terjadi pada penghantaran peptida cadherin menuju Blood Brain Barrier (BBB). Secara umum, interaksi peptida dengan ion logam dapat dipelajari secara eksperimental dan teoritik. Tujuan dari penelitian ini adalah menentukan struktur dengan energi minimum dari peptida Ac-CA-NH2 (Cys-Ala) dan Ac-VC-NH2 (Val-Cys) dan meenentukan kestabilan interaksi dari peptida Ac-CA-NH2 dan Ac-VC-NH2 dengan ion logam. Perhitungan dilakukan menggunakan tingkat teori dan basis set HF/ 6-31G** meliputi optimasi geometri molekul peptida, interaksi peptida dengan ion, dan penentuan HOMO-LUMO serta chemical shift. Hasil menunjukan bahwa telah didapatkan struktur dengan energi paling minimum pada peptida Ac-CA-NH2 dan Ac-VC-NH2 menunjukan bahwa didapatkan struktur dengan energy paling minimum sebesar -2,53.106 kJ/mol dan -2,74.106 kJ/mol yang dapat dibuktikan dengan konvergensi optimasinya. Pada interaksi peptida Ac-CA-NH2 dengan ion logam Na+ dan K+ didapatkan daerah yang paling stabil pada konfigurasi 2 paling stabil dengan energi interaksi -189,782 kJ/mol dan -141.280 kJ/mol sedangkan pada interaksi peptida Ac-VC-NH2 dengan ion logam Na+ dan K+ didapatkan informasi bahwa konfigurasi 1 paling stabil dengan energi interaksi -248,56 kJ/mol dan -181,022 kJ/mol.

ABSTRACT

Intermolecular interaction or non-covalent interaction plays important role on chemical process. One of the most important process that can be learnt are peptide-metal ion interaction that occurred when delivering cadherin peptide to Blood Brain Barrier (BBB). The purpose of this research is to determine the structure with minimum energy of Ac-CA-NH2 (Cys-Ala) and Ac-VC-NH2 (Val-Cys) peptide and determining the stability of interaction on Ac-CA-NH2 and Ac-VC-NH2 interaction with potassium and sodium ion, The calculations were carried out in string theory and basis sets HF/6-31G** including geometry optimization of peptide, peptide-ion interaction and determination of physical and chemical properties like HOMO LUMO and chemical shift. The results show that structure of Ac-CA-NH2 and Ac-VC-NH2 peptide were acquired with minimum energy at -2,53.106 kJ/mol dan -2,74.106 kJ/mol that can be proven by its optimization convergences. The interaction of Ac-CA-NH2 with natrium and potassium ion are obtained the most stable configurations on configuration 1 with interaction energy of -189,782 kJ/mol for natrium ion and 141.280 kJ/mol for potassium ion. Meanwhile in interaction of Ac-VC-NH2 peptides with natrium and potassium ion has the most stable configuration in configuration 1 with interaction energy -248,562 kJ/mol and -181,022 kJ/mol respectively.

---

Ketersediaan

1580C19I

1580 C 19-i

Perpustakaan FSM Undip (Referensi)

Tersedia

Informasi Detail

Judul Seri

KIMIA

No. Panggil

1580 C 19-i

Penerbit

: ., 2018

Deskripsi Fisik

-

Bahasa

Indonesia

ISBN/ISSN

-

Klasifikasi

1531

Tipe Isi

-

Tipe Media

-

Tipe Pembawa

-

Edisi

-

Subjek

-

Info Detail Spesifik

-

Pernyataan Tanggungjawab

Rinaldy Christian

Versi lain/terkait

Lampiran Berkas

Komentar

---

Anda harus masuk sebelum memberikan komentar