Text
Isolasi Dan Identifikasi Bakteri Dari Aliran Pembuangan Geo Dipa Pada Media Pengaya Nutrient Broth
RINGKASAN
Biodiversitas adalah keanekaragaman makhluk hidup yang menunjukkan
variasi gen, spesies, dan ekosistem di suatu daerah. Sejauh ini dilaporkan, kurang
dari 1% bakteri yang teridentifikasi sehingga lebih dari 99% bakteri di alam
belum teridentifikasi. Pegunungan Dieng merupakan salah satu dataran tinggi
yang didalamnya terdapat biodiversitas. Beberapa keanekaragaman bakteri yang
telah dilaporkan diantaranya, bakteri dari daun kentang Dieng teridentifikasi
sebagai Erwinia ananas. Selain itu, bakteri diisolasi dan teridentifikasi sebagai
Thermoanaerobacter yonseiensis dari kawah Sileri; dan bakteri Brevibacillus sp.
dari kawah Sikidang. PT Geo Dipa Energi adalah Pembangkit Listrik Tenaga
Panas Bumi di sekitar kawasan Dieng. Eksplorasi mikroorganisme dari aliran
pembuangan PT Geo Dipa belum pernah dilaporkan. Penelitian ini bertujuan
untuk mendapatkan isolat bakteri dari aliran pembuangan Geo Dipa dengan media
pengaya Nutrient Broth. Isolat yang diperoleh diidentifikasi secara fenotipik dan
genotipik.
Penelitian ini dilakukan dalam beberapa tahap meliputi sampling bakteri
dari aliran pembuangan Geo Dipa dengan media pengaya Nutrient Broth.
Kemudian, bakteri ditumbuhkan secara aerob dan mikroaerob. Identifikasi
fenotipik dilakukan dengan pewarnaan gram dan uji fisiologis. Uji fisiologis
meliputi uji pertumbuhan bakteri pada media talk teknis (mengandung silika) dan
media Pikovskaya (mengandung fosfat). Selain itu, bakteri diuji potensi enzim
ekstraselulernya yang meliputi amilase, protease, dan selulase. Identifikasi
genotipik dilakukan dengan menggunakan analisis urutan nukleotida gen 16S
rRNA.
Hasil penelitian diperoleh dua isolat bakteri dari aliran pembuangan Geo
Dipa pada media pengaya Nutrient Broth. Bakteri tersebut adalah bakteri aerob
yang diberi nama isolat GD-2 dan bakteri mikroaerob yang diberi nama isolat
GD-3. Isolat GD-2 memiliki karakteristik berbentuk batang dan gram negatif.
Isolat GD-2 memiliki kemiripan dengan bakteri kelompok Morganella morganii
dengan tingkat kekerabatan sebesar 98%. Di sisi lain, isolat GD-3 memiliki
karakteristik berbentuk bulat batang dan gram negatif. Isolat GD-3 memiliki
kemiripan dengan bakteri kelompok Acinetobacter nosocomialis dengan tingkat
kekerabatan sebesar 99%. Uji pertumbuhan pada media mengandung silika (talk
teknis) menunjukkan isolat GD-2 mampu tumbuh tetapi isolat GD-3 tidak mampu
tumbuh. Uji pertumbuhan pada media mengandung fosfat (Pikovskaya) kedua
isolat mampu tumbuh. Hasil pertumbuhan kedua isolat pada media talk teknis dan
Pikovskaya tidak menunjukkan zona bening. Hal ini mengindikasikan kedua isolat
tidak mampu mengurai silika dan fosfat. Isolat GD-2 dan GD-3 positif memiliki
enzim ekstraseluler amilase tetapi tidak memiliki enzim ekstraseluler protease dan
selulase.iv
SUMMARY
Biodiversity is the diversity of living things that shows the variation of
genes, species, and ecosystems in an area. It has been reported that less than 1%
bacteria has been identified. Dieng Mountains is one of the high plains. It has
biodiversity. Some of the bacterial diversity that has been reported such as, the
bacteria from the Dieng potato leaf is identified as Erwinia ananas. In addition,
the bacteria were isolated and identified as Thermoanaerobacter yonseiensis from
the Sileri crater; and bacteria Brevibacillus sp. from the Sikidang crater. PT Geo
Dipa Energi is a Geothermal Power Plant around Dieng area. The exploration of
microorganisms from the flow of disposal Geo Dipa has not been reported. The
aim of this research is to obtain bacterial isolates from the flow of disposal Geo
Dipa enriched with Nutrient Broth. Then, the isolates were identified
phenotypically and genotypically.
The study was done in several stages including bacterial sampling from
the flow of disposal Geo Dipa enriched with Nutrient Broth. After that, bacteria
grown in aerobic and microaerobic. Phenotypic identification is done by gram
staining and physiological test. Physiological tests include bacterial growth tests
on technical talk media (containing silica) and Pikovskaya media (containing
phosphate). In addition, the bacteria tested the potential of its extracellular
enzymes including amylase, protease, and cellulase. Genotypic identification is
done by analyzing the sequence of nucleotides of the 16S rRNA gene.
The results are obtained two bacterial isolates from the flow of disposal
Geo Dipa enriched with Nutrient Broth. There are aerobic bacteria named GD-2
isolates and microaerobic bacteria named GD-3 isolates. GD-2 isolate has
characteristic rod shape and gram negative. Isolate GD-2 has similarities with
Morganella morganii group bacteria with 98% homology. In the other hand, GD-
3 isolates has characteristic coccus-rod shape and gram negative. GD-3 isolate has
similarities with the bacteria Acinetobacter nosocomialis group with 99%
homology. The growth test on media containing silica (technical talk) showed
GD-2 isolate was able to grow but GD-3 isolate was unable to grow. The growth
test on phosphate media (Pikovskaya) showed both isolates were able to grow.
The results of growth of both isolates on technical talk media and Pikovskaya
showed no clear zone. This indicates that both isolates are not capable to
solubilizing silica and phosphate. GD-2 and GD-3 isolates positively have the
amylase extracellular enzyme but do not have extracellular enzyme protease and
cellulase.iv
ABTSRAK
Eksplorasi keanekaragaman bakteri dari Pembangkit Listrik Tenaga Panas
Bumi Geo Dipa-Dieng belum pernah dilaporkan. Penelitian dilakukan dalam
beberapa tahap meliputi sampling bakteri dari aliran pembuangan Geo Dipa
dengan media pengaya Nutrient Broth. Kemudian, bakteri ditumbuhkan secara
aerob dan mikroaerob. Identifikasi fenotipik dilakukan dengan pewarnaan gram
dan uji fisiologis. Uji fisiologis meliputi uji pertumbuhan bakteri pada media talk
teknis (mengandung silika) dan media Pikovskaya (mengandung fosfat). Selain
itu, bakteri diuji potensi enzim ekstraselulernya yang meliputi amilase, protease,
dan selulase. Identifikasi genotipik dilakukan dengan menggunakan analisis
urutan nukleotida gen 16S rRNA.Hasil yang diperoleh dari penelitian didapat dua
isolat yang diberi nama GD-2 (aerob) dan GD-3 (mikroaerob). Data fenotipik
menunjukkan isolat GD-2 berbentuk cembung dan negatif-batang, sedangkan
isolat GD-3 berbentuk datar, negatif, dan bulat-batang. Kedua isolat berwarna
putih tulang, tidak mampu mengurai media talk teknis dan Pikovskaya, mampu
menghasilkan enzim ekstraseluler amilase, tetapi tidak menghasilkan protease dan
selulase. Data genotipik menunjukkan kedekatan isolat GD-2 dengan Morganella
morganii dan isolat GD-3 dengan Acinetobacter nosocomialis.
Kata kunci: Biodiversitas, PLTPB Geo Dipa, Isolat GD-2, Isolat GD-3
ABSTRACT
The exploration of bacterial diversity from Geo Dipa-Dieng Geothermal
Power Plant has not been reported. The study was done in several stages
including bacterial sampling from the flow of disposal Geo Dipa enriched with
Nutrient Broth. After that, bacteria grown in aerobic and microaerobic.
Phenotypic identification is done by gram staining and physiological test.
Physiological tests include bacterial growth tests on technical talk media
(containing silica) and Pikovskaya media (containing phosphate). In addition, the
bacteria tested the potential of its extracellular enzymes including amylase,
protease, and cellulase. Genotypic identification is done by analyzing the
sequence of nucleotides of the 16S rRNA gene. The results are obtained two
isolates named GD-2 (aerob)and GD-3 (microaerob). Phenotyphic data showed
that GD-2 isolate is convex and negative-bacil, but GD-3 isolate is flat, negative,
coccus-bacil. Both isolates are white bones, unable to solubilize the technical talc
media and Pikovskaya, capable of producing extracellular amylase enzymes,but
do not produce proteases and cellulases. Genotyphic data showed neighborhood
of GD-2 isolate with Morganella morganii and GD-3 isolate with Acinetobacter
nosocomialis.
Keywords: Biodiversity, Geo Dipa Geothermal, GD-2 isolate, GD-3 isolate
1438C17IV | 1438 C 17-iv | Perpustakaan FSM Undip (Referensi) | Tersedia |
Tidak tersedia versi lain