Text
Interaksi Anion Halida Dengan Peptida CysAla Dan Peptida Valcys: Studi Komputasi Ab Initio
ABSTRAK
Interaksi ion dengan peptida maupun protein sangat penting karena mempengaruhi proses biologi, seperti meregulasi pH, pembentukan struktur kompleks, serta ion yang mempengaruhi neuron dalam proses penglihatan, pengecapan, maupun penciuman. Interaksi ion dan peptida terjadi saat transpor ion yang melalui membran sel dalam hal ini yaitu Brain Blood Barrier (BBB). Penelitian ini mempelajari posisi interaksi paling stabil dari interaksi anion halida dengan peptida CysAla dan peptida ValCys. Selain itu juga dipelajari pengaruh ukuran anion (anion halida) terhadap kestabilan peptida CysAla dan ValCys. Metode yang digunakan untuk mempelajari interaksi anion halida dan peptida CysAla maupun ValCys adalah metode komputasi ab initio. Pada penelitian ini digunakan teori Hartree-Fock, basis set 6-311G** dan aplikasi hitung NWCHEM. Hasil penelitian ini yaitu interaksi anion halida dengan peptida CysAla maupun ValCys paling stabil terjadi pada H yang berikatan dengan atom O. Terjadi penurunan selisih energi HOMO-LUMO menunjukan bahwa terjadi penurunan kestabilan peptida CysAla dan peptida ValCys seiring perbahan ukuran dan anion halida.
Kata kunci: Anion halida, peptida, interaksi, ab initio
ABSTRACT
The interaction of ions with peptides or proteins is very important in influencing biological processes, such as regulating pH, formation of complex structures, and ions that affect neurons in the process of sight, taste, and smell. The interaction of ions and peptides occurs when ion transport through the cell membrane in this case is the Brain Blood Barrier (BBB). The aims of this study is determine the most stable interaction positions of anion halide interactions with CysAla peptides and ValCys Peptides. It will also study the effect of anion size (anion halide) on the stability of CysAla and ValCys peptides. The methods used to study the interaction of anion halides and CysAla and ValCys peptides are ab initio computational methods. In this study used Hartree-Fock theory, 6-311G ** as basis set and NWCHEM as counting app. The result of this research is the interaction of the anion halide with CysAla and ValCys peptides most stable occurring in H that bind to the O atom. The decrease of HOMO-LUMO energy difference shows that there is a decrease in the stability of CysAla peptide and ValCys peptide as the size of the anion halide.
Keyword : Halide anion, Peptide, Interaction, Ab initio
1401C17IV | 541,3 ANI i | Perpustakaan FSM Undip (Referensi) | Tersedia |
Tidak tersedia versi lain