Text
Isolasi dan Identifikasi Molekuler Daerah ITS rDNA Fungi Endofit Pada Tanaman Lengkuas (Alpinia galanga (L.)Willd.)
ABSTRAK
Fungi endofit merupakan kelompok mikroorganisme yang tumbuh secara intra
dan interselullar pada jaringan tanaman tingkat tinggi tanpa menyebabkan gejala
penyakit pada tanaman inang. Fungi endofit yang umumnya bersifat mutualisme
terdapat pada hampir seluruh tumbuhan vaskular termasuk pada tanaman
Lengkuas (Alpinia galanga (L.)Willd.). Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi
dan mengidentifikasi secara molekuler fungi endofit pada tanaman lengkuas
(Alpinia galanga (L.)Willd) yang berasal dari kebun Pusat Penelitian Biologi-LIPI
menggunakan analisis rDNA pada daerah internal transcribed spacer (ITS).
Tahapan penelitian yang dilakukan meliputi : Isolasi fungi, pemurnian isolat
fungi, seleksi berdasarkan morfotipe, dan identifikasi molekuler. Hasil penelitian
memperoleh 57 Isolat fungi endofit yang berhasil diisolasi dari akar, batang semu,
daun dan rimpang tanaman lengkuas. Hasil Identifikasi molekuler menggunakan
daerah ITS menunjukkan bahwa, jumlah isolat terseleksi berdasarkan morfotipe
yang diperoleh pada akar lengkuas sebayak 5 isolat yang terdiri dari Diaphorte sp.
(AL 5-1), D. phaselorum (AL 5-2), Talaromyces flavus (AL 5-4), Colletotrichum
tropicale AL (6-1) dan Fusarium nematophilum (AL 6-2). Jumlah isolat yang
terseleksi pada batang lengkuas sebayak 7 isolat yang terdiri dari Colletotrichum
sp.( BL 1-1), Curvularia geniculata (BL 1-2), Colletotrichum siamense (BL 1-4),
Aspergillus aculeatus (BL 3-1), Dothideomycetes sp. (BL 4-3), Mycolepticus
indicus (BL 5-2), dan Neopestalotiopsis asiatica (BL 7-1). Isolat yang terseleksi
di bagian daun adalah Guignardia mangiferae (DL 3-2) dan isolat yang terseleksi
di bagian rimpang adalah Hypocreales sp.( RL 2-2).
Kata Kunci: fungi endofit, lengkuas, ITS, rDNAvi
ABSTRACT
Endophytic fungi are a group of microorganisms that grow in intra and
interselullar on high plant tissue without causing symptoms of disease in host
plants. Most mutualism endophytic fungi are present in almost all vascular plants
including the galangal (Alpinia galanga (L.) Willd.). This study aims to isolate
and identify molecular endophytic fungi on galangal plants (Alpinia galanga (L.)
Willd) derived from LIPI Bogor Research Center's of Biology using rDNA
analysis on internal transcribed spacer (ITS) region. Research stages consist of:
Fungi isolation, purification of fungi isolates, morphotype selection, and
molecular identification. The results obtained 57 isolates of endophytic fungi
successfully isolated from root, pseudo stem, leaf and rhizome of lengkuas plant.
The result of molecular identification using ITS region showed that the number of
isolates selected by morphotype obtained from galangal root were 5 isolates
consisting of Diaphorte sp. (AL 5-1), D. phaselorum (AL 5-2), Talaromyces
flavus (AL 5-4), Colletotrichum tropicale (AL 6-1) and Fusarium nematophilum
(AL 6-2). The number of isolates selected from the lengkuas stem were 7 isolates
consisting of Colletotrichum sp. (BL 1-1), Curvularia geniculata (BL 1-2),
Colletotrichum siamense (BL 1-4), Aspergillus aculeatus (BL 3-1) ,
Dothideomycetes sp. (BL 4-3), Mycolepticus indicus (BL 5-2), and
Neopestalotiopsis asiatica (BL 7-1). Selected isolate in the leaf section was
Guignardia mangiferae (DL 3-2) and the selected isolate in the rhizomes was
Hypocreales sp. (RL 2-2).
Key Words : endophytic fungi, lengkuas, ITS, rDNA
1118B17III | 620,8 YUR i | Perpustakaan FSM Undip (Referensi) | Tersedia |
Tidak tersedia versi lain