Text

Karakterisasi Fragmen 18S RNA Ribosomal Kentang (Solanum tuberosum L.) Varietas Granola L Menggunakan Aplikasi Primer Universal 18S

---

ABSTRAK

Kentang (Solanum tuberosum L.) merupakan komoditas unggulan dari
produk hortikultura. Salah satu varietas unggul dari kentang yang banyak
dibudidayakan di Indonesia adalah kentang varietas Granola L. Tujuan dari
penelitian ini yaitu untuk mengetahui hasil karakterisasi gen 18S rRNA kentang
varietas Granola L menggunakan aplikasi primer universal 18S yang ditunjukkan
dengan ciri dan hubungan kekerabatan kentang varietas Granola L secara
molekuler. Hasil karakterisasi fragmen 18S rRNA ini berguna dalam
pengembangan penelitian selanjutnya yaitu untuk melengkapi informasi secara
morfologi dengan informasi molekuler yang ditunjukkan dengan ciri-ciri dan
hubungan kekerabatan kentang varietas Granola L. Tahapan yang dilakukan
dalam penelitian ini yaitu isolasi DNA dari daun kentang varietas Granola L
menggunakan metode Doyle dan Doyle, amplifikasi gen 18S rRNA kentang
varietas Granola L, dan analisis sekuensing. Hasil sekuensing yang berupa urutan
basa 18S rRNA kentang varietas Granola L digunakan untuk konstruksi pohon
filogenetik. Poduk PCR dari amplifikasi gen 18S rRNA kentang varietas Granola
L menghasilkan ukuran sekuen sebesar 528 bp. Analisis filogenetik menunjukkan
adanya homologi sekuen sebesar 99 % dengan S. tuberosum. Hasil analisis
filogenetik kentang varietas Granola L menunjukkan bahwa kentang varietas
Granola L masih berkorelasi dekat hubungan kekerabatannya dengan salah satu S.
tuberosum X67238.1 dari Eropa.
Kata Kunci: Kentang varietas Granola L, Karakterisasi, 18S rRNA, sekuensing,
filogenetik

ABSTRACT

Potato (Solanum tuberosum L.) is a superior commodity of horticultural
products. One of the superior varieties of potatoes that are widely cultivated in
Indonesia is potato variety Granola L. The purpose of this research is to find out
the result of gene characterization 18S rRNA potato variety Granola L using
universal primer application 18S shown with characteristic molecularly and
relationship kinship potato variety Granola L. The result of characterization on
18S rRNA fragment is useful in the development of subsequent research that is to
complement the morphological information with molecular information indicated
by the characteristics and relationship kinship from potato variety Granola L.
Stages performed in this research are DNA isolation from potato leaf Granola L
using Doyle and Doyle method, gene amplification 18S Granola L potato rRNA,
and sequencing analysis. Sequencing results in the order of base 18S Granola L
potato rRNA are used for the construction of phylogenetic trees. The PCR product
and gene amplification of Granola L 18S rRNA potato yielded a sequence size of
528 bp. Phylogenetic analysis showed a sequence homology of 99% with S.
tuberosum. The results of potato variety Granola L phylogenetic analysis showed
that the potato variety Granola L was still correlated near its kinship relationship
with one of S. tuberosum X67238.1 from Europe.
Keywords: Granola L, Characterization, 18S rRNA, sequencing, phylogenetic

---

Ketersediaan

1113B17III

620,8 YUN k

Perpustakaan FSM Undip (Referensi)

Tersedia

Informasi Detail

Judul Seri

BIOLOGI

No. Panggil

1113 B 17 iii

Penerbit

: ., 2017

Deskripsi Fisik

-

Bahasa

Indonesia

ISBN/ISSN

-

Klasifikasi

1590

Tipe Isi

-

Tipe Media

-

Tipe Pembawa

-

Edisi

-

Subjek

-

Info Detail Spesifik

-

Pernyataan Tanggungjawab

Yunior William Susanto

Versi lain/terkait

Lampiran Berkas

Komentar

---

Anda harus masuk sebelum memberikan komentar