Text

Karakterisasi Molekuler Jeruk Bokor (Citrus sp.) dari Karimunjawa berdasar DNA Barcode 18S rRNA

---

ABSTRAK

Jeruk Bokor (Citrus sp.) merupakan jeruk yang berasal dari pulau Karimunjawa.
Buah ini dikenal sebagai spesies endemik, karena berasal dan tumbuh secara alami
di pulau tersebut. Jeruk adalah salah satu komoditas utama perkebunan Indonesia.
Konsumsi buah jeruk di Indonesia pada tahun 2012 mencapai 2,76 kg/kapita per
tahun, sedangkan produksi jeruk dalam negeri hanya 1,86 juta ton. Tingkat
keragaman jeruk di Indonesia sangat tinggi, namun karakterisasinya belum
dilakukan secara molekuler. Penelitian ini bertujuan untuk mengkarakterisasi
secara molekuler Jeruk Bokor (Citrus sp.) dari Karimunjawa berdasar 18S rRNA.
Tahap karakterisasi dimulai dengan Isolasi DNA dengan CTAB, lalu DNA
diamplifikasi secara dengan Polymerase chain reaction (PCR). DNA kemudian
dianalisis dengan Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) dan Molecular
Evolutionary Genetics Analysis (MEGA). Phylogenetik analisis Jeruk Bokor
(Citrus sp.) memperlihatkan kerabat terdekatnya adalah Citrus aurantium.
Kata Kunci: Jeruk Bokor Karimunjawa, Karakterisasi molekuler 18S rRNA, filogenetik

ABSTRACT

Bokor Orange is one of the orange fruits that grows on Karimunjava Island. This
fruit is known to be endemic of the island, because it grows naturally on the island.
Orange are one of the essential comodities of Indonesian agriculture product. It
consumption reaches 2,76 kg/capita a year by year of 2012, whereas the production
is only 1,86 million tons. Diversity of the orange in Indonesia are high, however the
characterization based on molecular identification is very rare. This research aimed
to charaterize Bokor Orange (Citrus sp.) from Karimunjava based on 18S rRNA. It
started by Isolating the DNA using CTAB method, then amplified the DNA with
Polymerase chain reaction (PCR). DNA then analyzed with Basic Local Alignment
Search Tool (BLAST) and Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA).
Phylogenetic analysis of of Bokor Orange (Citrus sp.) DNA, revealed that the
closest relation of the plant was Citrus aurantium.
Keywords: Karimunjawa Bokor Orange, 18S rRNA Molecular characterization, phylogenetics

---

Ketersediaan

1086B17II

620,8 FAV k

Perpustakaan FSM Undip (Referensi)

Tersedia

Informasi Detail

Judul Seri

BIOLOGI

No. Panggil

620,8 FAV k

Penerbit

: ., 2017

Deskripsi Fisik

-

Bahasa

Indonesia

ISBN/ISSN

-

Klasifikasi

1542

Tipe Isi

-

Tipe Media

-

Tipe Pembawa

-

Edisi

-

Subjek

-

Info Detail Spesifik

-

Pernyataan Tanggungjawab

Favian Syailendra Wardhana

Versi lain/terkait

Lampiran Berkas

Komentar

---

Anda harus masuk sebelum memberikan komentar