Text

Optimasi Pertumbuhan dan Potensi Antagonistik Bacillus pumilus terhadap Patogen Xanthomonas campestris serta Identifikasi Molekuler Gen Penyandi PKS dan NRPS 571.2 FAI o

---

ABSTRAK

Xanthomonas campestris merupakan salah satu patogen tanaman brokoli
yag sulit untuk diberantas. B. pumilus merupakan agen biokontrol yang prospektif
karena mampu menghasilkan senyawa antibakteri yang menghambat
pertumbuhan bakteri dan jamur patogen. Selain itu B. pumilus memiliki daya
tahan terhadap lingkungan ekstim dengan kemampuan pembentukan spora.
Beberapa spesies dari genus Bacillus telah dilaporkan memiliki gen yang
menyandi PKS (Polyketide Synthetase) dan NRPS (Non-Ribosomal Peptide
Synthetase) yang merupakan enzim mega sintetase untuk berbagai senyawa
antibiotik. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui daya hambat B. pumilus
terhadap X. campestris, mengidentifikasi gen penyandi PKS dan NRPS serta
mengetahui pertumbuhan optimum B. pumilus pada pH dan sumber karbon yang
berbeda. Penelitian dilakukan dengan Rancangan Acak Lengkap (RAL) dengan
tiga ulangan pada dua parameter pertumbuhan yang berbeda yaitu pH dan sumber
karbon. Perlakuan pH dilakukan pada pH 5, 6, 7, dan 8, sementara perlakuan
sumber karbon dilakukan dengan glukosa, fruktosa dan sukrosa sebagai sumber
karbon. Data yang diperoleh dianalisis dengan ANOVA dengan taraf signifikansi
95%. Hasil penelitian menunjukkan kemampuan B. pumilus untuk menghambat
pertumbuhan X. campestris menghasilkan zona hambat dengan diameter 1,84 mm.
Hasil identifikasi gen penyandi PKS menunjukkan hasil positif. Hasil analisis
penyejajaran sekuens dengan BLAST gen PKS B. pumilus menunjukkan
homologi sebesar 98% dengan gen PKS bakteri Bacillus subtilis HNS005.
Optimasi pertumbuhan menunjukkan pertumbuhan optimum B. pumilus pada pH
6 dan glukosa sebagai sumber karbon.
Kata kunci: biokontrol, B. pumilus, PKS, NRPS, optimasi pertumbuhan

ABSTRACT

Xanthomonas campestris is one of the broccoli pathogen that difficult to be
eradicated. B. pumilus is a prospective biocontrol agent due to its ability to
produce antibiotical subtances that inhibit the growth of pathogenic bacteri and
fungi. Beside that, B. pumilus have a great endurance to extreme environment by
its ability to form spores. Some species of Bacillus genus have been reported to
have PKS (Polyketide Synthetase) and NRPS (Non-Ribosomal Peptide
Synthetase) coding gene which is a mega shyntetase that have a role in the
production of antibiotic subtances. This reseach aims to test the inhibitory potency
of B. pumilus toward X. campestris, identify the PKS and NRPS coding gene and
to knwing the optimum growth of B. pumilus on the medium with different pH
and carbon source. Reseach is conducted with Completely Randomized Design
(CRD) with three replications on two growth parameters that is pH and carbon
source. pH treatment is conducted with pH 5, 6, 7, and 8, while carbon source
treatment is conducted with glucose, fructose, and sucrose as the carbon source.
The obtained result is analized with ANOVA with significant level of 95%. The
result shows B. pumilus ability to inhibits the growth of X. campestris producing
inhibitory zone with 1,84 mm of diameter. The reseach showed negative result in
NRPS coding gene detection and a positive result in PKS coding gene. PKS
coding gene identification which is analized with BLAST shows 98% homology
with PKS coding gene of Bacillus subtilis HNS005. Growth optimization shows
the optimum growth of B. pumilus at pH 6 and glucose as the carbon source.
Keywords: biocontrol, B. pumilus, PKS, NRPS, growth optimization

---

Ketersediaan

1052B17I

1052 B 17

Perpustakaan FSM Undip (Referensi)

Tersedia

Informasi Detail

Judul Seri

BIOLOGI

No. Panggil

1052 B 17

Penerbit

: ., 2016

Deskripsi Fisik

-

Bahasa

Indonesia

ISBN/ISSN

-

Klasifikasi

1444

Tipe Isi

-

Tipe Media

-

Tipe Pembawa

-

Edisi

-

Subjek

-

Info Detail Spesifik

-

Pernyataan Tanggungjawab

Laila Nur Faizah

Versi lain/terkait

Lampiran Berkas

Komentar

---

Anda harus masuk sebelum memberikan komentar