Text

Aplikasi Primer Univesal 18S Untuk Identifikasi Secara Molekuler Durian Vera

---

ABSTRAK

Tanaman durian merupakan tanaman endemik dan menjadi komoditas
dominan yang dapat ditemukan di seluruh Indonesia dengan berbagai ragam
varietas. Durian Vera merupakan salah satu durian unggul yang ditemukan di
Jawa Tengah. Identifikasi durian Vera secara molekuler belum pernah dilakukan
sebelumnya. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui hasil identifikasi secara
molekuler durian Vera menggunakan 18S RNA ribosomal, untuk mencari ciri-ciri
dan hubungan kekerabatan durian Vera. Penelitian dilakukan dengan mengisolasi
DNA durian Vera menggunakan metode Doyle & Doyle, dilanjutkan dengan
amplifikasi gen 18S rRNA dan analisis sekuensing. Urutan basa hasil sekuensing
digunakan untuk konstruksi pohon filogenetik. Hasil amplifikasi gen 18S rRNA
menghasilkan produk PCR sebesar 527 bp. Analisis kesamaan sekuen durian Vera
menunjukkan homologi sebesar 95% dengan Durio zibethinus dan perbedaan basa
sebesar 5%. Analisis pohon filogenetik menunjukkan durian Vera memiliki
hubungan dekat dengan Durio zibethinus. Namun, identifikasi secara morfologi
menunjukkan bahwa durian Vera 99% mirip dengan Durio zibethinus.
Kata Kunci: Durian Vera, Primer Universal 18S, Identifikasi Molekuler, 18S rRNA, Durio
zibethinus.

ABSTRACT

Durian is an endemic Indonesian plant and has become a dominant
commodity that can be found throughout Indonesia with various varieties. Durian
Vera is one of the famous durian found in Central Java. Molecular identification
of durian Vera has not been done yet. This research aimed to identify durian Vera
using 18S ribosomal RNA, to searching the characteristics and phylogenetic
relationship of durian Vera with Durio zibethinus. The research was done by
isolating DNA of durian Vera using Doyle and Doyle method, continued with 18S
rRNA gene amplification and sequencing analysis. The sequence was then used to
construct phylogenetic tree. The amplification of 18S rRNA gene produced the
PCR product of 527 bp. Sequence similarity analysis of Durian Vera showed 95%
homology with Durio zibethinus and 5% of sequence difference. Phylogenetic
tree analysis showed durian Vera has a close relationship with Durio zibethinus.
However, morphology identification of durian Vera showed that durian Vera 99%
similar with Durio zibethinus.
Keyword: Durian Vera, Universal Primer 18, 18S rRNA gene, Molecular Identification, Durio
zibethinus.

---

Ketersediaan

1019B16IV

571.2 APR a

Perpustakaan FSM Undip (Referensi)

Tersedia

Informasi Detail

Judul Seri

BIOLOGI

No. Panggil

571.2 APR a

Penerbit

: ., 2016

Deskripsi Fisik

-

Bahasa

Indonesia

ISBN/ISSN

-

Klasifikasi

1395

Tipe Isi

-

Tipe Media

-

Tipe Pembawa

-

Edisi

-

Subjek

-

Info Detail Spesifik

-

Pernyataan Tanggungjawab

Waheni Rizki Aprilia

Versi lain/terkait

Lampiran Berkas

Komentar

---

Anda harus masuk sebelum memberikan komentar