Text
Identifikasi Mikrobiota pada Saluran Pencernaan Udang Litopenaeus vannamei (Boone, 1931) dengan Perlakuan Pemberian Pakan Konsorsium Mengandung Trichoderma reesei Menggunakan Analisis Metabarcoding
Mikrobiota memainkan peran krusial dalam metabolisme dan sistem imun udang.
Apabila terdapat ketidakseimbangan dalam komunitas mikrobiota dapat
mempengaruhi kesehatan dan produktivitas udang. Penggunaan campuran pakan
konsorsium pada umumnya akan mempengaruhi kinerja mikrobiota di dalamnya
baik secara positif ataupun negatif. Tujuan dari penelitian ini adalah mengevaluasi
pengaruh campuran pakan konsorsium T. reesei terhadap keanekaragaman
mikrobiota di saluran pencernaan udang dan memeriksa keefektifan metode DNA
metabarcoding dalam analisis mikrobiota tersebut. Analisis DNA metabarcoding
dilakukan pada sampel usus udang yang diberi pakan mengandung campuran pakan
konsorsium dan kelompok kontrol menggunakan penanda 16s rRna secara highthroughput sequencing. Hasil menunjukkan peningkatan keanekaragaman
mikrobiota pada kelompok campuran pakan konsorsium dibanding kelompok
kontrol. Genus yang teridentifikasi memiliki dominansi dari filum Proteobacteria
yang berkontribusi pada pengaturan kualitas air budidaya dan pengaruh konsorsium
akan meningkatkan massa otot udang dan mempercepat pertumbuhan. Namun,
terdapat pengaruh negatif dari campuran pakan konsorsium ini yang menunjukkan
penurunan kelimpahan relatif keanekaragaman mikrobiota yang mengindikasikan
adanya kompetisi antar mikrobiota. Genus bakteri yang teridentifikasi tergolong
sulit apabila dianalisis menggunakan metode konvensional. Analisis
metabarcoding mendeteksi genus bakteri secara bersamaan dengan cepat dan
efisien, namun metode ini memerlukan perhatian khusus terhadap potensi deteksi
data mikrobiota palsu akibat kontaminasi.
Kata Kunci: Litopenaeus vannamei, 16s rRNA, Pakan konsorsium, DNA Metabarcoding,
Trichoderma reesei
| 1837 B 2024 | 1837 B 2024 | Perpustakaan FSM Undip | Tersedia |
Tidak tersedia versi lain