Text

Study of Interaction Between ADTC-5 (Ac-CDTPPVC-NH2) and E-Cadherin using Molecular Dynamic with pH variation and Mechanical Quantum Method

---

Blood Brain Barrier (BBB) adalah penghalang yang berada di otak yang
berfungsi untuk meregulasi pergerakan senyawa yang menuju ke otak. Peptida
ATD6 menunjukan hasil yang baik untuk meningkatkan penghantaran obtak ke
otak melalui BBB. Turunan dari ADT6 dapat berinteraksi dengan sisi pengikatan
pada E-Cadherin dan menggangu interaksi antara EC1…EC1 pada adherent
junction untuk memodulasi BBB. ADTC5 memiliki kemampuan terbaik untuk
memodulasi interaksi EC1…EC1.
Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menentukan pH terbaik untuk
interaksi E-Cadherin…ADTC5 sebagai pemodulasi interaksi EC1…EC1 di
Paracellular Pathway dan melakukan studi stabilitas interaksi asam amino pada pH
terbaik. Metode yang digunakan pada penelitian ini adalah Dinamika Molekular
(MD) dan Mekanika Quantum (QM). Simulasi dinamika molekular digunakan
untuk memprediksi pergerakan setiap atom pada protein dan molekul lain seiring
waktu dengan memperhatikan interaksi antar atomik yang terjadi. Mekanika
Quantum digunakan untuk menentukan berbagai sifat seperti geometri, energi
interaksi, HOMO-LUMO dengan mempertimbangkan pengaruh dari elektron.
Hasil molekular dinamik menunjukan bahwa interkasi antara ECadherin…ADTC5 yang paling stabil dan kuat terjadi pada pH 7.4. Interkasi asam
amino antara E-Cadherin…ADTC5 yang terjadi pada pH 7.4 adalah
Alanin43…Valin6, Valin48…Prolin5, Glysin49…Prolin5, Isoleusin52…Asetat0,
Isoleusin53…Cystein1 and Arganin55…Aspartat2. Berdasarkan energi interaksi,
interaksi terkuat terjadi pada Arg55…Asp2 dengan energi -78 kJ/mol dan interaksi
terlemah terjadi pada Ile52…Ace0 dengan energi -40 kJ/mol. HOMO-LUMO gap
tertinggi terjadi pada Ile52…Ace0 dan terendah terjadi pada Ile53…Cys1.
Kata Kunci: BBB, E-Cadherin, ADTC5, MD, QM

---

Ketersediaan

2151C2023

2151 C 2023

Perpustakaan FSM Undip

Tersedia

Informasi Detail

Judul Seri

-

No. Panggil

2151 C 2023

Penerbit

: .,

Deskripsi Fisik

-

Bahasa

Indonesia

ISBN/ISSN

-

Klasifikasi

NONE

Tipe Isi

-

Tipe Media

-

Tipe Pembawa

-

Edisi

-

Subjek

-

Info Detail Spesifik

-

Pernyataan Tanggungjawab

Moch Freskha Fauzi Royhansyah

Versi lain/terkait

Lampiran Berkas

Komentar

---

Anda harus masuk sebelum memberikan komentar