Text
Profil Agregasi Fosfolipida Dengan Penambahan Kolesterol Dan Bahan Aktif Melalui Simulasi Dinamika Molekuler Berbasis Coarse-Grained
Vitamin C dan beta-karoten merupakan bahan aktif yang dibutuhkan dalam tubuh
manusia namun mudah teroksidasi. Dibutuhkan enkapsulan seperti fosfolipida untuk
melindungi vitamin C dan beta-karoten. Fosfolipida mampu membentuk struktur liposom
yang dapat mengenkapsulasi vitamin C dan beta-karoten dengan kemampuan swarakitnya.
Meskipun penelitian secara in vitro telah dilakukan, studi dinamika molekuler mengenai
fosfolipida yang diberi penambahan kolesterol, vitamin C, dan beta-karoten belum pernah
dilakukan sebelumnya. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui struktur,
karakter, dan profil hasil agregasi fosfolipida dengan penambahan kolesterol, vitamin C,
dan beta-karoten. Penelitian ini menggunakan struktur coarse-grained 3-dimensi
fosfolipida (DLPS, DOPS, DLiPS, DLiPC), kolesterol, vitamin C, dan beta-karoten agar
penelitian dapat dilakukan pada perangkat dengan spesifikasi standar tanpa mengurangi
informasi molekulnya. Tahap-tahap dalam penelitian ini meliputi preparasi awal, preparasi
akhir, simulasi Coarse Grained-Molecular Dynamics (CG-MD) dan analisis hasil CG-MD.
Simulasi dilakukan menggunakan perangkat lunak Nanoscale Molecular Dynamics
(NAMD). Analisis hasil simulasi meliputi kestabilan konformasi melalui nilai Root Mean
Square Deviation (RMSD), profil energi melalui nilai energi total dan waktu hidup, area
per lipid, diameter liposom, dan ketebalan membran. Analisis dan visualisasi dilakukan
menggunakan perangkat lunak Visual Molecular Dynamics (VMD), Grace, GNU Image
Manipulation Program (GIMP), dan MS. Excel. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa
secara in silico sistem membentuk berbagai macam struktur metastabil seperti concave
micelle, disc-like micelle, toroidal micelle, dan liposom serta struktur stabil seperti planar
bilayer. Sistem dengan penambahan konsentrasi kolesterol 30% dan 40% juga memiliki
potensi paling kuat dalam membentuk liposom dibandingkan konsentrasi lain, dengan
ataupun tanpa vitamin C dan beta-karoten. Penambahan kolesterol meningkatkan nilai
energi total, ketebalan membran, diameter liposom, dan waktu hidupnya. Simulasi
dinamika molekuler ini mampu memberikan prediksi bahwa liposom mampu
mengenkapsulasi vitamin C dan beta-karoten dengan baik melalui profil hasil agregasinya.
Kata Kunci : Fosfolipida, Agregasi, Dinamika Molekuler, NAMD, Coarse-Grained
Tidak ada salinan data
Tidak tersedia versi lain