vannamei terinfeksi IMNV diambil dari daerah budidaya udang utama
Indonesia, yaitu Lampung, Gresik, dan Pontianak. Sampel positif IMNV
diamplifikasi gen penyandi RNA polimerasenya pada daerah 12 dan 13
dengan metode RT-PCR menggunakan primer spesifik. Hasil amplifikasi
disekuensing dan dianalisis dengan program BioEdit 7.1.3.0, ClustalW2,
CLC free workbench 6.6.2. dan ClustalX. Hasil penelitian memperlihatkan
karakter gen RdRp IMNV asal Lampung dan Gresik memiliki homologi basa
sebesar 98,04-99,58% dengan IMNV asal Brazil (accession no. AY570982).
Namun analisis asam amino memperllihatkan karakter gen RdRp IMNV asal
Lampung memperlihatkan homologi sebesar 100% dengan IMNV asal Brazil